次氯酸鈉溶于水可產生次氯酸，次氯酸是一種強氧化劑能夠殺死水里的細菌，次氯酸能使染料和有機色質褪色可用作漂白劑。在廢水處理中也是常用氧化劑中的其中一種，在堿性條件下用次氯酸作氧化劑將氰化物氧化破壞而除去。

　　次氯酸鈉在消毒上是具有明顯優勢的，作為一種好的滅菌、殺病毒藥劑，它同水的親和性很好，能與水任意比互溶不存在液氯，二氧化氯等藥劑的隱患且消毒效果被公認為和氯氣相當，也正是因為這一特點所以它消毒效果好投加準確操作正確，使用方便，易于儲存，對環境污染小，不存在跑氣泄露，可以任意環境工作狀況下投加。

　　次氯酸鈉廣泛應用于包括自來水、中水、工業循環水、游泳池水、醫院污水等等各種水體的消毒，次氯酸鈉還能夠破壞氰根離子和苯環等用作處理含氰廢水和一些工業中毒污染廢水的氧化，還可以用于紙漿等漂白高濃度的次氯酸鈉液體還可以用于剝離設備及管道上附著的沾泥。

　　在消毒方面,值得肯定的是,由于次氯酸鈉發生器所生產的消毒液中不象氯氣、二氧化氯等消毒劑在水中產生游離分子氯,所以,一般難以形成因存在分子氯而發生氯代化合反應,生成不利于人體健康的有毒有害物質.并且,次氯酸鈉也不會象氯氣同水反應會形成鹽酸那樣,對金屬 管道構成嚴重腐蝕.不過,它同氨可以發生反應,在水中生成微量的帶有氣味的氯氨化合物,但這種物質也是一種環保的殺生藥劑,只是遠不及次氯酸鈉的殺生能力。